SDK Ignatius Slamet Riyadi II berdiri sejak tahun 1981. Pada awal berdirinya, pelaksanaan Kegiatan Belajar Mengajar (KBM) dilaksanakan Siang sampai Sore hari karena pembanguan gedung sekolah belum selesai dan KBM menggunakan Gedung SDK Slamet Riyadi I. Setelah Pembangunan gedung pada tahun 1991, SDK Ignatius Slamet Riyadi II melaksanakan KBM pada pagi hingga siang hari seperti sekolah pada umumnya.